Desde el inicio de sus actividades en la Unidad se ha trabajado en tres vertientes; Licenciatura, Posgrado y Formación Continua, siendo el objetivo principal de esto, el atender las necesidades más apremiantes de la práctica docente en el municipio y el Estado en general
En el nivel licenciatura los trabajos se iniciaron en la Unidad en atención a maestros en servicio para su nivelación a nivel licenciatura, sin embargo, como resultado del reordenamiento de la oferta educativa a partir del 2003 se oferta la licenciatura en Intervención Educativa (LIE) programa dirigido a egresados del bachillerato, con dos líneas específicas: Gestión Educativa y Educación Inicial, actualmente se está en revisión para ofertar otras líneas específicas de egreso como son la de inclusión social, educación de jóvenes y adultos, y orientación educativa, cabe precisar que esto es resultado de la firma del Acuerdo de la SEP publicado en el Diario Oficial de la federación con fecha 25 de junio de 2001; en el mismo sentido desde agosto del 2021 se está ofertando la licenciatura en Pedagogía la cual tiene como finalidad formar profesionales capaces de analizar la problemática educativa y de intervenir de manera creativa en su solución mediante el dominio de las políticas educativas, la organización y los programas del sistema educativo y del conocimiento de las bases teórico metodológicas de la Pedagogía.
Respecto al Posgrado en la UPN unidad Mexicali, la Maestría en Educación Campo Formación Docente, fue pionera en esta región ofreciendo la oportunidad al magisterio de profesionalizarse, en este campo específico, hasta el 2022 han egresado 29 generaciones.
De igual manera la Maestría en Educación Ambiental se convirtió desde 1993 en otra opción para quienes buscaban desempeñarse en ese ámbito educativo, siendo el propósito de este programa educativo aportar soluciones desde el contexto educativo a la problemática ambiental actual.
En los años recientes esta unidad ha incrementado su oferta a nivel posgrado con la especialización en estudios de género en educación, la Maestría en Educación Básica 2011 y la Maestría en Educación Media Superior en 2015, todos estos impulsan la profesionalización de los docentes en los ámbitos mencionados.
Aunado a lo anterior a mediados del 2016 se inició el programa de Doctorado Regional en Desarrollo Educativo con Énfasis en Formación de Profesores.
